晶状体相关的葡萄膜炎应与眼球穿透伤后或白内障术后眼内炎、交感性眼炎、特发性葡萄膜炎、强直性脊椎炎伴发的葡萄膜炎、Reiter综合征伴发的葡萄膜炎、牛皮癣性关节炎伴发的葡萄膜炎、炎症性肠道疾病伴发的葡萄膜炎、幼年型慢性关节炎伴发的葡萄膜炎、结核性葡萄膜炎、梅毒性葡萄膜炎等相鉴别。
1.眼球穿透伤后或白内障术后眼内炎 有2种类型，一种为急性术(伤)后眼内炎，常发生于术(伤)后2～7天，表现为眼红、眼痛、畏光、流泪、视力下降、眼睑肿胀、结膜水肿、角膜水肿及浸润、前房内有大量炎症细胞、前房积脓或纤维素性渗出、玻璃体混浊、视网膜静脉周围炎、视网膜坏死等;另一种类型为迟发型术(伤)后眼内炎，发生于白内障术后或眼球穿透伤后数周或数月，症状较轻，可有眼红、眼痛、畏光、流泪、视力下降等，可出现羊脂状KP、前房闪辉和前房炎症细胞。根据上述表现，外伤后或术后急性眼内炎一般不难与晶状体相关的葡萄膜炎相鉴别，但迟发型术(伤)后眼内炎则易于与晶状体相关的葡萄膜炎相混淆。鉴别的要点为迟发型术(伤)后眼内炎可出现人工晶状体表面肉芽肿性沉积物、晶状体囊袋内奶油色斑，甚至囊袋内积脓，组织学检查和眼内标本培养可确定诊断。
2.晶状体相关的双侧葡萄膜炎 主要发生于白内障摘除术后及损伤晶状体的眼球穿透伤后，双眼先后发病，主要表现为轻度至中度的前葡萄膜炎，偶尔引起中间葡萄膜炎和眼后段受累，玻璃体和前房炎症细胞主要为中性粒细胞，清除晶状体物质后炎症不再复发。
3.交感性眼炎 发生于各种眼球穿透伤和内眼术后，双眼常同时发病或间隔时间短，主要表现为全葡萄膜炎，也可表现为后葡萄膜炎或前葡萄膜炎，可引起脉络膜增厚、浆液性视网膜脱离，病程长者可出现Dalen-Fuchs结节、晚霞状眼底改变，玻璃体和房水中的细胞主要为淋巴细胞。根据上述特点，一般可以将它们区别开来。
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